根尖切除術是切除牙齒的根尖，并刮除根尖周病變組織的手術。適用于根管治療失敗而無法除去根管充填材料；根管彎曲、狹窄；根管器械折斷在根管內，堵塞不通；根尖折斷已形成慢性根尖周炎；慢性根尖周炎合并難于取出的超填根管充填材料等情況。一般只用于前牙、前磨牙，磨牙可視解剖情況酌情處理。術前拍X線片了解牙根形態、位置、與鄰近組織關系、骨質破壞范圍、根管治療情況。術前患牙最好做過根管充填，或手術同時作好根管充填。

　　術前半小時酌情給病人口服鎮靜劑和抑制唾液分泌的藥物。手術區消毒預備、備好吸唾器、局麻。在患牙根尖部做半圓形切口，長約1.5～2cm。翻瓣。

確定根尖所在位置，去骨開窗，顯露患牙根尖。用刮匙刮凈根尖周肉芽等病變組織，用裂鉆或鑿切斷去除根尖約2mm （盡量少切牙根主體，保留牙骨質，至少保留牙根的2/3），并將根周骨質與牙根斷面銼磨平滑。清理沖洗后，將粘骨膜瓣復回原位，間斷縫合。

術后必要時給予抗菌素，1周內不能咬硬物，飯后用鹽水漱口，保持口腔清潔，1周后拆線，傷口2周內愈合。術后3個月、6個月、 12個月定期復查，拍X線片。一般新生骨6～12個月填滿骨腔。近年來有人報道用羥基磷灰石（HA）及磷酸三鈣（TCP）材料作為骨腔內充填材料，顯示了明顯的生物相容性，如果再加上骨誘導蛋白（BMP），效果更為理想。